Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf653Q6YND2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf653Q6YND2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf653Q6YND2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms