Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rhox8Q6VSS7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rhox8Q6VSS7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rhox8Q6VSS7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Rhox8Q6VSS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rhox8Q6VSS7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms