Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9c1Q6UJY2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc9c1Q6UJY2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc9c1Q6UJY2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9c1Q6UJY2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms