Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2b4Q6Q477 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b4Q6Q477 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b4Q6Q477 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms