Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms