Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HjurpQ6PG16 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms