Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd4Q6PDQ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd4Q6PDQ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms