Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SvoplQ6PDF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms