Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atl2Q6PA06 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms