Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsen2Q6P7W5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tsen2Q6P7W5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tsen2Q6P7W5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms