Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc148Q6P5U8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc148Q6P5U8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms