Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc189Q6NZQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms