Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptpdc1Q6NZK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms