Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rprd2Q6NXI6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rprd2Q6NXI6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rprd2Q6NXI6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms