Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cpsf6Q6NVF9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms