Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HelbQ6NVF4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelbQ6NVF4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms