Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2surpQ6NV83 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2surpQ6NV83 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms