Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms