Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fbxo41Q6NS60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fbxo41Q6NS60 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms