Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt42Q6IFX2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt42Q6IFX2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt42Q6IFX2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms