Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9bQ6EBV9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms