Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lemd2Q6DVA0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lemd2Q6DVA0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lemd2Q6DVA0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms