Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TroQ6DIC6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms