Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltn1Q6A009 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltn1Q6A009 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms