Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2cQ69ZS6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2cQ69ZS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms