Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzrn3Q69ZS0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzrn3Q69ZS0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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