Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pkp4Q68FH0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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