Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ino80dQ66JY2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ino80dQ66JY2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms