Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja3Q64448 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja3Q64448 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja3Q64448 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms