Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlh2Q64221 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlh2Q64221 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms