Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc18Q640L5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc18Q640L5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc18Q640L5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
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