Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phc1Q64028 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc1Q64028 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phc1Q64028 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phc1Q64028 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phc1Q64028 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc1Q64028 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc1Q64028 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc1Q64028 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc1Q64028 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc1Q64028 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms