Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ift52Q62559 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ift52Q62559 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ift52Q62559 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ift52Q62559 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ift52Q62559 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ift52Q62559 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms