Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx1Q62443 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms