Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs1Q62417 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs1Q62417 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs1Q62417 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs1Q62417 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sorbs1Q62417 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sorbs1Q62417 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs1Q62417 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs1Q62417 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms