Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TrhQ62361 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrhQ62361 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrhQ62361 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrhQ62361 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms