Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SypQ62277 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SypQ62277 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SypQ62277 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SypQ62277 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SypQ62277 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SypQ62277 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SypQ62277 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SypQ62277 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SypQ62277 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SypQ62277 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SypQ62277 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SypQ62277 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SypQ62277 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SypQ62277 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SypQ62277 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SypQ62277 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SypQ62277 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SypQ62277 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SypQ62277 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SypQ62277 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SypQ62277 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SypQ62277 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SypQ62277 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SypQ62277 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SypQ62277 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SypQ62277 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SypQ62277 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SypQ62277 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SypQ62277 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SypQ62277 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SypQ62277 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SypQ62277 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SypQ62277 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SypQ62277 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SypQ62277 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SypQ62277 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SypQ62277 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SypQ62277 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms