Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sall3Q62255 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sall3Q62255 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms