Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms