Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx3xQ62167 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx3xQ62167 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms