Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3bQ62141 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3bQ62141 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms