Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Odf1Q61999 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Odf1Q61999 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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