Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LbpQ61805 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LbpQ61805 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbpQ61805 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbpQ61805 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbpQ61805 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LbpQ61805 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbpQ61805 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms