Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EsrrbQ61539 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EsrrbQ61539 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EsrrbQ61539 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms