Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg1aQ61495 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg1aQ61495 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms