Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlcamQ61490 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlcamQ61490 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms