Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccna1Q61456 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccna1Q61456 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms