Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2bQ61313 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2bQ61313 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms