Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a1Q61165 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms