Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc6Q61143 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms